科学家深入研究关键蛋白 向新的COVID-19药物和疫苗迈出关键一步
俄勒冈州立大学理学院的研究人员通过深入研究一种蛋白质与SARS-CoV-2遗传物质的相互作用,向防治COVID-19的新药和疫苗迈出了关键一步。该病的核衣壳蛋白或N蛋白是抗病干预的首要目标,因为它为新冠病的感染周期执行了关键工作,而且它的变异速度相对较慢。围绕N蛋白的工作而建立的药物和疫苗具有高效、长效的潜力--即不易产生耐药性。
在SARS-CoV-2蛋白中,N蛋白是病RNA的最大“伙伴”。RNA拥有病用来让活细胞(如人体细胞)制造更多自身的遗传指令,而N蛋白则与RNA结合并保护它。
而最新发表在《生物物理学杂志》上的研究结果,是对N蛋白及其与RNA相互作用进行更多研究的重要跳板,是彻底研究SARS-CoV-2感染、传播和控制机制的一部分。
俄勒冈州立大学生物化学和生物物理学教授Elisar Barar和博士候选人Heather Masson-Forsythe在本科生Joaquin Rodriguez和Seth Pinckney的帮助下领导了这项研究。研究人员使用了一系列生物物理技术,测量N蛋白与基因组RN段--3万个核苷酸基因组的1000个核苷酸--结合时的大小和形状变化。
"对于病来说,基因组是相当大的,需要许多N蛋白的副本粘在RNA上,使病具有球形的形状,这是病制造更多副本所必需的,"Barar说。"我们的研究帮助我们量化了需要多少个N的拷贝,以及它们粘在RNA上时彼此之间的距离有多近。”
Barar说,通过核磁共振对N与大段RNA进行生物物理研究是非常罕见的,因为制备部分无序的N蛋白和长段RNA的难度很大,都容易发生聚集和降解,但这类研究是Barar实验室的专长。研究者的研究一般都局限于小得多的RN段和小块的N蛋白。
1000个核苷酸的观点让科学家们了解到,当蛋白质是全长二聚体--两个拷贝互相连接时,蛋白质的结合力要强得多,而不是只单研究N蛋白的RNA结合区域,并确定蛋白质中对RNA结合至关重要的区域。
“蛋白有结构化的部分,但实际上的很灵活,所以我们知道这种灵活性对RNA结合很重要,”Masson-Forsythe说。“我们还知道,当N蛋白开始与较长的RNA结合时,其结果是与一种结合方式相反的多种结合蛋白/RNA复合物的。”
她说,因此,阻挠N蛋白灵活性的药物将是制药研究人员的一个潜在途径。另一种可能性是任何那些被证明具有特殊意义的蛋白质/RNA复合物的药物。
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