植物新药研发获重要数据

　　又名，是全球重要的药用植物之一。植株所含生物碱种类达100多种，其中五大主要成分、、、那可丁和碱是医药工业中用于合成品、止痛药、和镇定药物的重要生物碱。此外，它还产生一些苄基异喹啉生物碱（BIAs），具有强有效的药理学特性。

　　目前，已经成为研究BIAs生物合成的模式植物。但因中的具有极易成瘾性，是制备类的主要原材料。因此，在一些国家，尤其在我国，的种植和运输受到严格管控。

　　但另一方面，我国在剂、止痛药方面的需求缺口较大，例如当量需求缺口高达84%。因此，通过分子标记辅助育种开发不产而生产具有重要药用成分的品种，或高产的新品种是遗传育种的重要研究方向。

　　可喜的是，近，河北医科大学、中国工程院院士丛斌，公安部物证鉴定中心裴黎、王白石博士课题组通过综合利用二代Illumina测序和Hi-C技术，获得了一个2.62 G中国本土（CHM）参考基因组。并基于已发表的高那可丁品种（HN1）三代测序基因组数据将获得基因组挂载到了11条拟染色体上，最长scaffold为287.96M，superscaffolds N50为227.38M，重复序列占基因组的例约为65.79%。通过BUSCO评估，该研究获得CHM基因组组装结果（96.4%）较HN1更为完整（93.1%）。该研究注释得到了79,668个蛋白编码基因，功能注释率为88.9%，而HN1为68.8%。研究应用获得的CHM基因组更新了HN1基因组数据并进行了共线性分析。相关研究发表在《园艺研究》上。

　　研究人员对科植物的基因家族和4DTv较分析表明，共经历了两次全基因组复制（D）事件。远期的D为远古毛茛目植物共有，与特征性次级代谢产物产生和抗病性相关的基因家族得到了扩张，而近期由转座因子介导的物种特有D导致了基因组的大规模扩张，这可能是自身较大基因组以及BIAs生物碱含量大量生成和积累的主要原因。

　　此外，研究人员还通过对CHM和HN1的多部位和发育阶段的转录组较，发现两者间存在着与农艺性状相关的基因结构变异，揭示了新品种形成的遗传学机制。

　　业内人士表示，该研究为今后的新品种构建，植物源性新药研发提供重要基础数据，具有很高的科学价值。

　　据悉，该研究得到了国家自然科学基金和中央级公益性科研院所基本科研业务费基金的资助。

　　相关论文信息：s://doi.org/10.1038/s41438-020-00435-5